(一)
作为区域经济一体化产物的经济合作组织，在世界范围内不断出现。这些组织范围大小不同，层次高低有异，组织形式多样，各显特色。北部湾经济合作亦不例外，它将建立与自己的情况相适应的合作机制。
２００４年，中越两国总理共同提出建立包括北部湾经济圈在内的“两廊一圈”的创议。从那以后，北部湾经济合作一直得到中越两国最高领导层的关怀和支持，自上而下层层推动，具有战略高度和旺盛势头。这是北部湾经济合作的最大优势。
北部湾区位优越，机遇套叠。北部湾处在中国和东南亚的交接处，是中国大西南最近的出海口。北部湾区域包括在中国-东盟自由贸易区、泛珠三角等多个经济合作的框架之内，跟“两廊”合作互为表里，面临多重机遇，获得多重动力。这是北部湾经济合作的独特优势。
北部湾经济合作具有多层面的特点。北部湾１２万平方公里海域，分属中越两国。东面是中国的海南和广东，北面是中国的广西，西面是越南的临湾省市，南面连接广阔的南海，遥望菲律宾、印尼等东南亚国家。北部湾经济合作包括国际、国内、省区内等三个层面。
北部湾区域具有地理多元化的特点，涵盖海湾、海岛、半岛、大陆等部分。广阔的空间，多元的自然环境，孕育着多样的资源和产业，有利于开展广泛的经济合作。
北部湾属经济欠发达地区，经济关联度低。广西属中国西部，湛江属广东欠发达的西部，海南经济总量还不大，越南临湾地区的发展水平也不高。在这种情况下，北部湾各方之间经济联系薄弱，很多地方相互之间至今还没有经济往来。这是北部湾经济发展根本性的先天不足。
受经济水平普遍低下的制约，北部湾区域至今还没有形成一个其实力足以影响各方统领全局的经济中心城市。没有龙头自然也就相应缺乏区域经济的向心力。这是北部湾经济合作的又一先天不足。
目前，北部湾区域经济合作的积极性还有待提高，合作共赢的意识还不强。笔者最近随北部湾经济圈课题组访问了一些环湾和邻近城市，曾多次听到诸如“我们跟北部湾经济联系不多”、“我们不属北部湾经济圈”等议论。
北部湾部分新兴产业雷同，竞争大于合作。近年来北部湾城市竞相兴建大型石化工业和林浆纸工业。如果说石化工业所需原油主要来自国外，原油之争短期内还不会出现的话，林浆纸工业所需原料则主要来自国内的环湾省区，原木之争估计将登上经济舞台。
(二)
从北部湾区域现实出发，北部湾经济合作既遵循区域经济的共同规律，又应充分体现自己的个性和侧重点。
平等自愿。任何区域经济合作，都必须在保持参加者独立性的前提下，在平等自愿的基础上进行。这一原则对由两国多方参与的北部湾经济合作尤其重要。
互利共赢。这是任何区域经济合作的出发点和归宿。在经济合作中，在权利义务均等的前提下，任何一方的权益都不会受损，只会从合作中受益；任何一方发展经济的积极性都不会遭抑，只会从合作中更加焕发；没有输家，都是赢家，通过合作实现共同的更快的发展。
异中求同。不同的事物，相异是绝对的，相同是相对的，合作的真谛就是异中求同。区域经济合作的任务就是在承认、尊重各方特性和利益的基础上，努力寻求当前和长远的共同利益，亦即找到各方利益的结合点，在利益结合点上进行合作。
循序渐进。历史证明，任何区域经济合作——不论是经济发达区域，还是欠发达区域，或者两者皆有的区域——都是一个历史过程，从松散到严密，从初级到高级，与经济发展同步俱进。当前国际区域经济合作发展程度最高、其基本成员属发达国家的欧洲联盟，其发展已有半个多世纪的历史；由发展中国家组成的东南亚国家联盟，也已有近４０年的存在。作为欠发达区域的北部湾，经济合作正待起步，其起始阶段的组织机构可能比较松散，其运作方式可能较有弹性，需要有长远的战略眼光，循序渐进，不能操之过急，假以时日才能水涨船高。
(三)
北部湾国际经济合作组织框架设想：
（一）中越两国领导人关于北部湾经济合作的定期会晤，这是最高决策机制。
（二）中越两国环湾省区市领导人定期磋商，并成立北部湾经济合作委员会作为最高执行机构，贯彻两国领导人的决策，讨论并推动具体合作事宜。
（三）常设办事机构，驻地由两国商定。
北部湾国内经济合作组织框架设想：
（一）广东、海南、广西三省区领导人的定期会晤。这是北部湾国内区域经济合作最高决策机制。
（二）北部湾国内环湾城市领导人定期磋商。保留并充实加强现有的北部湾经济合作组织，作为北部湾国内区域经济合作的最高执行机构，以贯彻三省区领导人的决策，讨论推动具体合作事宜；保留并加强现有的北部湾经济合作组织联络处，继续作为常设办事机构，处理日常事务。
（三）北部湾经济合作组织及其常设办事机构继续设在湛江。湛江目前是北部湾最大的港口城市，位于广西和海南之间，兼临北部湾和南海，位置适中；作为北部湾经济合作组织２０００年成立以来一直挂靠的城市，湛江为北部湾经济合作作出了很大贡献。
北部湾省区内经济合作组织框架设想：
广西将包括南宁在内的北部湾区作为开发开放的重点区域。２００４年，广西启动沿海基础设施建设第一期工程；２００６年３月，正式成立北部湾（广西）经济区规划建设管理委员会，统一规划、统一管理北部湾区的建设。２００６年７月，又启动规模更大的总投资近６０亿元的第二期工程。北部湾广西区的经济已经进入快速发展的新时期，与此同时，北部湾广西区的经济合作正朝统一规划、统一建设、统一管理的区域经济一体化的高级阶段前进。
北部湾将以创新的富有区域特色的经济合作机制，为构建北部湾经济圈，为北部湾的整体繁荣提供强大的动力。